В ответ на эти набеги шведы предприняли Первый крестовый поход (1157) против язычников-финнов. Он увенчался завоеванием юго-западной Финляндии и распространением там христианства. Во время Второго крестового похода (1249-1250) были покорены центральные районы южной Финляндии, а во время Третьего похода (1293-1300) власть шведов распространилась на восточные районы. На завоеванных землях были сооружены крепости. Таким образом шведское государство проникло в восточную часть Балтийского региона, однако на эти же земли претендовала Россия, искавшая выход по морю в Европу.
В 1323 между Швецией и Новгородом был заключен Ореховецкий (Нотебургский) договор, наметивший границу между Финляндией и русскими землями.

Финляндия получила некоторые выгоды от объединения со Швецией, будучи интегрирована в состав Швеции. Представители Финляндии с 1362 принимали участие в избрании королей Швеции. Принятие новой религии сопровождалось распространением европейских обычаев, нравов и культуры. Смешанные браки между финнами и шведами расширили представительство финнов в органах местного управления. Воцарение династии Ваза в Швеции привело к установлению более эффективного правления в Финляндии. К этому же времени относится становление финского литературного языка, отцом которого был священник Микаэль Агрикола, начавший переводить на финский язык библию. С 1548 на финском языке стали проводиться церковные службы.

В 17 в. Швеция предприняла некоторые усовершенствования административной системы в Финляндии. Шведский генерал-губернатор Пер Браге ввел апелляционный суд и основал университет в Турку, а также предоставил права самостоятельности городам. Представители Финляндии были допущены в шведский риксдаг. Хотя эти реформы в первую очередь затронули интересы шведской знати, жившей в Финляндии, местные крестьяне тоже извлекали от них некоторую выгоду.

В стране сравнительно рано началось развитие ремесел и товарно-денежных отношений. Крестьяне наряду с сельским хозяйством занимались кузнечным делом, ткачеством, смолокурением, распиловкой леса. Началась добыча полезных ископаемых, помещики основывали небольшие металлургические заводы, работавшие на древесном угле. Часть продукции помещичьих и государственных предприятий и изделий крестьянского и цехового ремесла (смола, бумага) шла на экспорт. Взамен импортировались хлеб, соль и некоторые другие товары.

Осложняло положение Финляндии ее географическое расположение в качестве буфера между Россией и Швецией, что делало ее на протяжении 15 - начала 19 вв. театром военных действий в русско-шведских войнах в борьбе за господство на Балтике. Во время Великой Северной войны (1700-1721) Финляндия оказалась оккупирована русскими войсками. Война сопровождалась голодом и эпидемиями, от которых погибла почти половина населения страны. В 1721 на территории Финляндии осталось всего 250 тыс. человек. После победы России в Северной войне при Петре I был заключен Ништадтский мирный договор (1721), по которому к России отошли Лифляндия, Эстляндия, Ингерманландия, часть Карелии и Моозундские острова. Россия вернула Швеции большую часть Финляндии и уплатила 2 млн. ефимков компенсации за приобретенные Россией земли.

Стремясь захватить у России земли, завоеванные Петром I, Швеция объявила ей в 1741 войну, но уже через год вся Финляндия оказалась снова в руках русских. По Абоскому мирному договору 1743 к России отошла территория до р. Кюмийоки с укрепленными городами Вильманстранд (Лаппенранта) и Фридрихсгам (Хамина).